Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RTL8BQ17RB0 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RTL8BQ17RB0 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms