Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SSX1Q16384 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SSX1Q16384 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SSX1Q16384 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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SSX1Q16384 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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SSX1Q16384 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SSX1Q16384 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SSX1Q16384 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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