Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms