Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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VAMP3Q15836 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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VAMP3Q15836 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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VAMP3Q15836 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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VAMP3Q15836 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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