Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SYCP1Q15431 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SYCP1Q15431 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
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