Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
NKX1-1Q15270 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NKX1-1Q15270 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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