Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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HERPUD1Q15011 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
HERPUD1Q15011 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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