Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SMC1AQ14683 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SMC1AQ14683 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms