Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
MDC1Q14676 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MDC1Q14676 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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