Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SCN5AQ14524 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SCN5AQ14524 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms