Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ITGA9Q13797 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ITGA9Q13797 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ITGA9Q13797 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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