Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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APOFQ13790 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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APOFQ13790 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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APOFQ13790 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
APOFQ13790 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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APOFQ13790 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
APOFQ13790 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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