Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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