Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TUBB3Q13509 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TUBB3Q13509 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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