Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TOP3AQ13472 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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