Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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FOXE3Q13461 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXE3Q13461 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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