Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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