Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN3Q13064 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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