Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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PTPRMP28827 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRMP28827 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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