Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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PTPRBP23467 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRBP23467 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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