Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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LHX9Q9NQ69 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
LHX9Q9NQ69 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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