Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ERGIC2Q96RQ1 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms