Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UHRF2Q96PU4 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms