Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ZBED3Q96IU2 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ZBED3Q96IU2 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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