Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms