Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SNX29Q8TEQ0 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms