Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDKN3Q16667 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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