Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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ECM1Q16610 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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ECM1Q16610 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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ECM1Q16610 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ECM1Q16610 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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