Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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