Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USF2Q15853 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
USF2Q15853 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
USF2Q15853 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms