Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHRNA6Q15825 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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