Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NPTX1Q15818 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms