Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERC1Q15751 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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