Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
GPNMBQ14956 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms