Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SCARF1Q14162 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms