Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A2Q14055 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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