Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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PDE6HQ13956 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PDE6HQ13956 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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