Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
APOFQ13790 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
APOFQ13790 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
APOFQ13790 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms