Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBA3CQ13748 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBA3CQ13748 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBA3CQ13748 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TUBA3CQ13748 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TUBA3CQ13748 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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