Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MSLNQ13421 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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