Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ITGB3BPQ13352 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms