Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.38
ATMQ13315 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ATMQ13315 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ATMQ13315 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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