Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NME3Q13232 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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NME3Q13232 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NME3Q13232 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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