Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
GRIN2BQ13224 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
GRIN2BQ13224 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms