Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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CALCOCO2Q13137 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CALCOCO2Q13137 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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