Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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GRIN2AQ12879 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2AQ12879 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2AQ12879 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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