Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PGGT1BP53609 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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PGGT1BP53609 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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PGGT1BP53609 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PGGT1BP53609 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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