Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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HOXD10P28358 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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HOXD10P28358 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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HOXD10P28358 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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HOXD10P28358 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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HOXD10P28358 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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HOXD10P28358 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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