Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms