Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap4s1Q9WVL1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap4s1Q9WVL1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms